スティッチの由来って、ゴキブリとこうもりの両方聞いたことがあるんですけど、本当は何なんですか？？

作品世界内の説明としては、実験生物なので由来という意味がどこにハマるかわからないですが何の動物でもないと思います。
おそらくクリエイターCサンダースの発言あたりからゴキブリやらコウモリの名前が挙がっているのだと思いますが、スティッチのクリエイションには様々な動物が入っていると思われます。
ゴキブリがあがる理由は壁をひたひたと歩く姿を指していると思われますしコウモリは悪魔の化身のようなシュルエッとを演出する部分をさしていると思われます。

以下は私見ですが、企画初期の段階ではグレムリンなどの80年代モンスターの影響も濃厚に感じますし、ファイナルで採用されている背中のヒレは一時話題になったチュパカブラが入っているように見て取れます。（チュパカブラ＝南米で話題になった宇宙人のペットと仮説されるモンスター。牛の血を吸うとされる。）

質問の意図が、汲み取れているか心配ですが“本当のモデル”をいうのであれば、様々な動物……架空、実在含め……様々な生物がモデルになって生まれたキャラクターだと回答すれば間違いがないと思います。